Phystech Accelerator
supports the entrepreneurial ecosystem of
the MIPT University
Need help with Bioinformatics?
- Shortage of qualified bioinformatician specialists in ongoing processes
- Problems in designing and execution of a complicated researches
- Lack of specific expertise

Scientific groups of the MIPT University are ready to help you
Leave your email, and we will reach out to you ASAP:
General Services
Comparative Genome Analysis, Custom scripting, and special projects, Read Filtering and Cleaning, Genome Annotation, Genome Mapping, Machine learning methods consulting, Bioinformatics Consulting, NGS: Next Generation Sequencing Analysis, Biostatistical Design, In Silico Cancer Genomics Analysis

Transcriptomics
Transcriptome Annotation, Transcriptome de novo Assembly, Transcriptome Mapping
In Silico Cancer Transcriptomic Analysis

Epigenetics
ChIP-Seq Analysis, Differential Gene Expression Analysis, Small RNA Annotation,
Small RNA Mapping, Epigenomics Analysis, In Silico Epigenetic Compound Library Screening

Targeted Capture Analysis and SNP/SV/CNV
Targeted Capture Analysis, SNP / Indel Calling, SNP / Indel Mapping, SNP/SV/CNV Discovery


Development of: a database structure, data exchange tunnels, data processing algorithms, indicator calculation algorithms, data analysis algorithms, analytical applications



Our laboratories
Laboratory of Bioinformatics of Cellular Technologies
The laboratory specializes in developing chemo- and bioinformatics resources for streamlining cell engineering experiments and identifying the fundamental foundations of cell transitions. The laboratory has exceptional knowledge in gene expression changes, expression in single cells, and transcription factors.
Head of the laboratory Yulia A Medvedeva, Ph.D.
h-index 16
i10-index 21

Newest co-authored publications
- RADICL-seq identifies general and cell type–specific principles of genome-wide RNA-chromatin interactions
Nature communications 11 (1), 1-14 4 2020
- Practical Guidance in Genome-Wide RNA: DNA Triple Helix Prediction
International Journal of Molecular Sciences 21 (3), 830 2020
- CpG traffic lights are markers of regulatory regions in human genome
BMC genomics 20 (1), 102

Most popular co-authored publications
- A promoter-level mammalian expression atlas
Nature 507 (7493), 462-470 777 2014
- An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5′ ends
Nature 543 (7644), 199-204 408 2017
- HOCOMOCO: a comprehensive collection of human transcription factor binding sites models
Nucleic acids research 41 (D1), D195-D202
Laboratory of translational genome bioinformatics
The laboratory's mainline aims to create a large-scale analysis of genetic information applicable to cancer diagnosis and prediction and optimize their therapy. In particular, special attention is paid to transcriptome profiling and the study of the activation of intracellular signaling pathways as predictors of cancer development and the success of various types of therapy.
Head of the laboratory, Anton Buzdin, Ph.D.
h-index 34
i10-index 81
He has several joint publications with Charles Cantor, ex-director of the Human Genome Project

Newest co-authored publications -
- RNA sequencing profiles and diagnostic signatures linked with response to ramucirumab in gastric cancer
Molecular Case Studies 6 (2), a004945 2 2020
- Diversity of Clinically Relevant Outcomes Resulting from Hypofractionated Radiation in Human Glioma Stem Cells Mirrors Distinct Patterns of Transcriptomic Changes
Cancers 12 (3), 570 2020
- Molecular heterogeneity in breast carcinoma cells with increased invasive capacities
Radiology and Oncology 54 (1), 103-118

Most popular co-authored publications
- Retroelements and their impact on genome evolution and functioning
Cellular and molecular life sciences 66 (23), 3727 127 2009
- Genetics and epigenetics of aging and longevity
Cell Cycle 13 (7), 1063-1077 118 2014
- The human genome contains many types of chimeric retrogenes generated through in vivo RNA recombination
Nucleic acids research 31 (15), 4385-4390 111
Laboratory for Health Analysis and Health Digitalization
The main activity of the laboratory is the analysis of statistical data on the incidence of the population.
An example of the application of researches is epidemic modeling.
Head of the laboratory, S. Vladimirov, Ph.D.
h-index 21
i10-index 24

The research Group have more than 40 publications in Lancet and Nature journals

Newest co-authored publications
- Global, regional, and national incidence, prevalence, and mortality of HIV, 1980–2017, and forecasts to 2030, for 195 countries and territories: a systematic analysis for the Global Burden of Diseases, Injuries, and Risk Factors Study 2017
The Lancet HIV 6 (12), e831-e859
- Mapping 123 million neonatal, infant and child deaths between 2000 and 2017
Nature 574 (7778), 353-358
- Past, present, and future of global health financing: a review of development assistance, government, out-of-pocket, and other private spending on health for 195 countries, 1995–2050
The Lancet 393 (10187), 2233-2260

Most popular co-authored publications
- Global, regional, and national incidence, prevalence, and years lived with disability for 310 diseases and injuries, 1990–2015: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2015
The Lancet 388 (10053), 1545-1602
- Global, regional, and national comparative risk assessment of 84 behavioural, environmental and occupational, and metabolic risks or clusters of risks, 1990–2016: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2016
The Lancet 390 (10100), 1345-1422
- Global, regional, and national incidence, prevalence, and years lived with disability for 310 diseases and injuries, 1990–2015: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2015
The Lancet 392 (10159), 1736-1788
Talk To Us
Our sientists are ready to discuss your challenges
Since 2020, PhA has been engaged in attracting R&D contracts in the MIPT laboratory. We are focused on the international market of bioinformatics tasks.
PhA Team
Sergey Dashkov
Leader

Alexey Lukasov
CEO

Anna Fedorova
Project manager

Contacts
Fiztehpark
Moscow, Dolgoprudnenskoe highway, 3

hello@pha.vc
About Us
Media
LEGAL INFORMATION
Terms of use
Connect us
© 2020 Phystech Accelerator
Пользовательское соглашение на обработку персональных данных
1. Общие положения
Настоящая политика обработки персональных данных составлена в соответствии с требованиями Федерального закона от 27.07.2006. №152-ФЗ «О персональных данных» и определяет порядок обработки персональных данных и меры по обеспечению безопасности персональных данных компании ООО «Физтех Акселератор» (далее – Оператор).
1.1. Оператор ставит своей важнейшей целью и условием осуществления своей деятельности – соблюдение прав и свобод человека и гражданина при обработке его персональных данных, в том числе защиту прав на неприкосновенность частной жизни, личной и семейной тайны.
1.2. Настоящая политика Оператора в отношении обработки персональных данных (далее – Политика) применяется ко всей информации, которую Оператор может получить о посетителях веб-сайта http://pha.vc.
1.3. Пользователь подтверждает, что все указанные им на сайте персональные данные, обработка которых может быть осуществлена только с согласия субъекта персональных данных, принадлежат лично ему.

2. Основные понятия, используемые в Политике
2.1. Автоматизированная обработка персональных данных – обработка персональных данных с помощью средств вычислительной техники;
2.2. Блокирование персональных данных – временное прекращение обработки персональных данных (за исключением случаев, если обработка необходима для уточнения персональных данных);
2.3. Веб-сайт – совокупность графических и информационных материалов, а также программ для ЭВМ и баз данных, обеспечивающих их доступность в сети интернет по сетевому адресу http://pha.vc;
2.4. Информационная система персональных данных — совокупность содержащихся в базах данных персональных данных, и обеспечивающих их обработку информационных технологий и технических средств;
2.5. Обезличивание персональных данных — действия, в результате которых невозможно определить без использования дополнительной информации принадлежность персональных данных конкретному Пользователю или иному субъекту персональных данных;
2.6. Обработка персональных данных – любое действие (операция) или совокупность действий (операций), совершаемых с использованием средств автоматизации или без использования таких средств с персональными данными, включая сбор, запись, систематизацию, накопление, хранение, уточнение (обновление, изменение), извлечение, использование, передачу (распространение, предоставление, доступ), обезличивание, блокирование, удаление, уничтожение персональных данных;
2.7. Оператор – государственный орган, муниципальный орган, юридическое или физическое лицо, самостоятельно или совместно с другими лицами организующие и (или) осуществляющие обработку персональных данных, а также определяющие цели обработки персональных данных, состав персональных данных, подлежащих обработке, действия (операции), совершаемые с персональными данными;
2.8. Персональные данные – любая информация, относящаяся прямо или косвенно к определенному или определяемому Пользователю веб-сайта http://pha.vc;
2.9. Пользователь – любой посетитель веб-сайта http://pha.vc;
2.10. Предоставление персональных данных – действия, направленные на раскрытие персональных данных определенному лицу или определенному кругу лиц;
2.11. Распространение персональных данных – любые действия, направленные на раскрытие персональных данных неопределенному кругу лиц (передача персональных данных) или на ознакомление с персональными данными неограниченного круга лиц, в том числе обнародование персональных данных в средствах массовой информации, размещение в информационно-телекоммуникационных сетях или предоставление доступа к персональным данным каким-либо иным способом;
2.12. Трансграничная передача персональных данных – передача персональных данных на территорию иностранного государства органу власти иностранного государства, иностранному физическому или иностранному юридическому лицу;
2.13. Уничтожение персональных данных – любые действия, в результате которых персональные данные уничтожаются безвозвратно с невозможностью дальнейшего восстановления содержания в информационной системе персональных данных и (или) результате которых уничтожаются материальные носители,, содержащие в себе персональные данные.

3. Оператор может обрабатывать следующие персональные данные Пользователя
3.1. Фамилия, имя, отчество;
3.2. Электронный адрес;
3.3. Номера телефонов;
3.4. Название компании, должность;
3.5. Также на сайте происходит сбор и обработка обезличенных данных о посетителях (в т.ч. файлов «cookie») с помощью сервисов интернет-статистики (Яндекс Метрика и Гугл Аналитика и других).
3.6. Вышеперечисленные данные, далее по тексту Политики, объединены общим понятием Персональные данные.

4. Цели обработки персональных данных
4.1. Цель обработки персональных данных Пользователя — предоставление доступа Пользователю к сервисам, информации и/или материалам, содержащимся на веб-сайте; информирование Пользователя о мероприятиях, программах, проектах Акселератора, в том числе партнерских проектах и программах, направление ответов на обращения Пользователя на сайтах и иных информационных ресурсах, иное взаимодействие Акселератора и его партнеров с Пользователем, в том числе связанное с реализацией программ и проектов, в том числе партнерских программ и проектов.
4.2. Также Оператор имеет право направлять Пользователю уведомления о новых продуктах и услугах, специальных предложениях и различных событиях. Пользователь всегда может отказаться от получения информационных сообщений, направив Оператору письмо на адрес электронной почты hello@pha.vc с пометкой «Отказ от уведомлений о новых продуктах, услугах и специальных предложениях».
4.3. Обезличенные данные Пользователей, собираемые с помощью сервисов интернет-статистики, служат для сбора информации о действиях Пользователей на сайте, улучшения качества сайта и его содержания.

5. Правовые основания обработки персональных данных
5.1. Оператор обрабатывает персональные данные Пользователя только в случае их заполнения и/или отправки Пользователем самостоятельно через специальные формы, расположенные на сайте http://pha.vc. Заполняя соответствующие формы и/или отправляя свои персональные данные Оператору, Пользователь выражает свое согласие с данной Политикой.
5.2. Оператор обрабатывает обезличенные данные о Пользователе в случае, если это разрешено в настройках браузера Пользователя (включено сохранение файлов «cookie» и использование технологии JavaScript).

6. Порядок сбора, хранения, передачи и других видов обработки персональных данных
Безопасность персональных данных, которые обрабатываются Оператором, обеспечивается путем реализации правовых, организационных и технических мер, необходимых для выполнения в полном объеме требований действующего законодательства в области защиты персональных данных.
6.1. Оператор обеспечивает сохранность персональных данных и принимает все возможные меры, исключающие доступ к персональным данным неуполномоченных лиц.
6.2. Персональные данные Пользователя никогда, ни при каких условиях не будут переданы третьим лицам, за исключением случаев, связанных с исполнением действующего законодательства.
6.3. В случае выявления неточностей в персональных данных, Пользователь может актуализировать их самостоятельно, путем направления Оператору уведомление на адрес электронной почты Оператора hello@pha.vc с пометкой «Актуализация персональных данных».
6.4. Срок обработки персональных данных является неограниченным. Пользователь может в любой момент отозвать свое согласие на обработку персональных данных, направив Оператору уведомление посредством электронной почты на электронный адрес Оператора hello@pha.vc с пометкой «Отзыв согласия на обработку персональных данных».

7. Трансграничная передача персональных данных
7.1. Оператор до начала осуществления трансграничной передачи персональных данных обязан убедиться в том, что иностранным государством, на территорию которого предполагается осуществлять передачу персональных данных, обеспечивается надежная защита прав субъектов персональных данных.
7.2. Трансграничная передача персональных данных на территории иностранных государств, не отвечающих вышеуказанным требованиям, может осуществляться только в случае наличия согласия в письменной форме субъекта персональных данных на трансграничную передачу его персональных данных и/или исполнения договора, стороной которого является субъект персональных данных.

8. Заключительные положения
8.1. Пользователь может получить любые разъяснения по интересующим вопросам, касающимся обработки его персональных данных, обратившись к Оператору с помощью электронной почты hello@pha.vc.
8.2. В данном документе будут отражены любые изменения политики обработки персональных данных Оператором. Политика действует бессрочно до замены ее новой версией.
8.3. Актуальная версия Политики в свободном доступе расположена в сети Интернет по адресу http://pha.vc.
8.4. Согласие Пользователя на обработку персональных данных является конкретным, информированным и сознательным.
8.5. Настоящее Соглашение Пользователем признается равносильным заключенному в простой письменной форме.
8.6. Оператор имеет право вносить изменения в настоящее Соглашение в любой время.



This site was made on Tilda — a website builder that helps to create a website without any code
Create a website